提供了一種大片段DNA的提取方法，包括三個(gè)步驟：（1）樣品研磨與裂解：其中使用了包含PVP、焦亞硫酸鈉、氯化鈉、Tris、EDTA和SDS的第一溶液和核糖核酸酶A；（2）抽提：分別使用了5M醋酸鈉的第二溶液，包含PEG8000和氯化鈉的...

本發(fā)明公開(kāi)了一種亞群特異共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)鑒定方法。本發(fā)明提供了一種待測(cè)樣本亞群特異共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)鑒定方法，包括如下步驟：1)將待測(cè)樣本亞群中每個(gè)樣本的各個(gè)基因原始UMI數(shù)量數(shù)值均一化處理；2)將原始UMI均一化結(jié)果過(guò)濾，3)計(jì)算過(guò)濾后基因的兩兩加...

本發(fā)明提出了一種基因組目標(biāo)區(qū)域富集方法。該方法包括：(1)將DNA片段樣本進(jìn)行環(huán)化處理；(2)將環(huán)化處理產(chǎn)物與目標(biāo)區(qū)域特異性引物或目標(biāo)區(qū)域特異性探針結(jié)合；以及(3)將結(jié)合有目標(biāo)區(qū)域特異性引物或目標(biāo)區(qū)域特異性探針的環(huán)化處理產(chǎn)物進(jìn)行滾環(huán)擴(kuò)增。

本發(fā)明公開(kāi)了確定生物樣本中預(yù)定來(lái)源的游離核酸比例的方法及裝置，包括：(1)對(duì)含有游離核酸的生物樣本進(jìn)行核酸測(cè)序，以便獲得由多個(gè)測(cè)序數(shù)據(jù)構(gòu)成的測(cè)序結(jié)果；(2)將所述測(cè)序結(jié)果與參照序列比對(duì)，以便確定所述測(cè)序結(jié)果中落入預(yù)定窗口的測(cè)序數(shù)據(jù)的數(shù)目...

提供一種用于檢測(cè)微量變異的DNA標(biāo)簽，該標(biāo)簽具有選自下列至少之一的序列：(1)HHATHHHTCACCHHATHHH；或(2)HHHTAHHTAHHHTAHH，其中，H代表A、T或C。

本發(fā)明公開(kāi)了一種精確定量腫瘤標(biāo)準(zhǔn)品中突變支持reads數(shù)的方法。該方法包括如下步驟：根據(jù)腫瘤標(biāo)準(zhǔn)品的突變信息，組裝參考序列；采用比對(duì)軟件對(duì)參考序列依次進(jìn)行建索引、比對(duì)、過(guò)濾、排序和去重，得到目標(biāo)reads；將目標(biāo)reads和參考序列進(jìn)行...

本申請(qǐng)公開(kāi)了一種用于核酸樣品標(biāo)識(shí)的基因標(biāo)簽、試劑盒及其應(yīng)用。本申請(qǐng)的用于核酸樣品標(biāo)識(shí)的基因標(biāo)簽，為一段長(zhǎng)度大于130bp的核酸，核酸序列的3’端具有polyA尾，并且核酸序列中隨機(jī)位置插入有至少一段index序列。

一種基于點(diǎn)擊化學(xué)的測(cè)序接頭、雙條形碼測(cè)序文庫(kù)及其構(gòu)建方法，該測(cè)序接頭包括：日期片段，包括5’端的與正向引物部分或全部序列一致的序列、中間的日期條形碼序列以及3’末端的點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)基團(tuán)；樣本片段頂鏈，包括5’末端的點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)基團(tuán)、中間的...

本申請(qǐng)公開(kāi)了一種用于微量FFPE?RNA樣本評(píng)估的方法、試劑盒及應(yīng)用。本申請(qǐng)的用于微量FFPE?RNA樣本評(píng)估方法，包括選取靶標(biāo)片段，采用靶標(biāo)片段的特異性引物和探針，對(duì)微量FFPE?RNA樣本進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR；并采用標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行相對(duì)定...

一種基于單引物探針捕獲檢測(cè)微生物目標(biāo)序列的方法，包括：將包含微生物目標(biāo)序列的DNA樣本片段化，然后進(jìn)行末端修復(fù)；將末端修復(fù)后的DNA片段連接接頭；使用單引物探針與靶序列的探針結(jié)合位點(diǎn)退火并延伸以進(jìn)行靶序列捕獲，其中探針結(jié)合位點(diǎn)位于靶序列...

一種雙端分子標(biāo)簽接頭及其用途和帶有該接頭的測(cè)序文庫(kù)，該雙端分子標(biāo)簽接頭包括第一鏈序列和第二鏈序列，第一鏈序列的3’端包括2至4個(gè)堿基組成的分子標(biāo)簽和至少1個(gè)具有堿基平衡作用的堿基位；第二鏈序列的5’端包括2至4個(gè)堿基組成的分子標(biāo)簽和至少...

本申請(qǐng)公開(kāi)了一種用于核酸測(cè)序儀清洗的試劑和方法。本申請(qǐng)用于核酸測(cè)序儀清洗的試劑由強(qiáng)堿、蒸餾水、非極性溶劑和吐溫組成，強(qiáng)堿為氫氧化鈉或氫氧化鉀，非極性溶劑為乙醇、甲醇或乙醚，吐溫為吐溫20或吐溫21。本申請(qǐng)的試劑，特別針對(duì)核酸測(cè)序儀中存在...

一種統(tǒng)計(jì)DNA拷貝數(shù)信息的方法、裝置及存儲(chǔ)介質(zhì)。該方法包括：獲取目標(biāo)基因組的全基因組測(cè)序讀段數(shù)據(jù)；將所述測(cè)序讀段數(shù)據(jù)比對(duì)到參考基因組以去除未比對(duì)上的讀段及重復(fù)讀段；分別計(jì)算基于排列組合的染色體非整倍性評(píng)估值PECA和基于排列組合的單臂不...

本發(fā)明提出了一種淋巴瘤基因捕獲芯片。該芯片包括：基體，探針，所述探針設(shè)置在所述基體上，所述探針特異性識(shí)別表1所示基因的至少之一。該芯片包括了常見(jiàn)高發(fā)淋巴腫瘤各亞型的相關(guān)Driver?Gene、高頻突變基因、癌癥相關(guān)5條信號(hào)通路中的重要基...

本發(fā)明公開(kāi)了檢測(cè)鏈特異性效率的成套試劑與方法。本發(fā)明公開(kāi)的檢測(cè)鏈特異性效率的成套試劑由SEQ?ID?NO:1?6所示的RNA組成，檢測(cè)鏈特異性效率的方法，包括：向待建庫(kù)的RNA中添加本發(fā)明的成套試劑，后進(jìn)行鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建，然后進(jìn)...

本申請(qǐng)公開(kāi)了一種與遺傳性聽(tīng)力損失疾病相關(guān)的核酸及其應(yīng)用。本申請(qǐng)與遺傳性聽(tīng)力損失疾病相關(guān)的核酸，由野生型ATP8A2基因的編碼區(qū)發(fā)生c.3389G>C突變而成。本申請(qǐng)的核酸是遺傳性聽(tīng)力損失疾病的一種新的相關(guān)的致病核酸，該核酸或致病突變位點(diǎn)...

本申請(qǐng)公開(kāi)了一種用于地中海貧血檢測(cè)的探針、基因芯片及制備方法和應(yīng)用。本申請(qǐng)的用于地中海貧血檢測(cè)的探針的制備方法，包括根據(jù)不同地中海貧血基因、修飾基因和不同突變，構(gòu)建捕獲區(qū)間庫(kù)；據(jù)此設(shè)計(jì)捕獲探針；捕獲區(qū)間庫(kù)包括，alpha基因簇和beta...

一種環(huán)狀探針和基于環(huán)狀探針捕獲的測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建方法，該方法包括：將環(huán)狀探針與靶標(biāo)核酸退火雜交，其中環(huán)狀探針為線性核酸探針，其包括兩個(gè)末端的特異性臂區(qū)和中間的通用序列，其中特異性臂區(qū)用于與靶標(biāo)核酸雜交，雜交后探針的兩個(gè)末端首尾相向，通用序列...

一種適用于下一代測(cè)序平臺(tái)的低起始量建庫(kù)方法，包括：DNA片段化；末端修復(fù)；用磁珠純化末端修復(fù)產(chǎn)物，并保留磁珠在體系中；接頭連接；用磁珠純化接頭連接產(chǎn)物兩次，并去除磁珠；以純化的接頭連接產(chǎn)物為模板，進(jìn)行PCR擴(kuò)增；用磁珠篩選第一次PCR擴(kuò)...

本申請(qǐng)公開(kāi)了一種提高免疫組庫(kù)多重PCR建庫(kù)質(zhì)量的方法及其應(yīng)用。本申請(qǐng)的提高免疫組庫(kù)多重PCR建庫(kù)質(zhì)量的方法，包括以含已知比例基因片段的核酸標(biāo)準(zhǔn)品為模板；采用多重引物組進(jìn)行PCR擴(kuò)增、建庫(kù)和測(cè)序；分析測(cè)序結(jié)果中各基因片段比例；比較分析的比...